IE6では ＜select＞オブジェクトが常に最前面にきてしまうので、それより上にレイヤーを重ねることができない。

それを回避するにはレイヤーよりz-indexが小さいインラインフレームを挿入すればいいみたいです

参考：

http://programming-magic.com/?id=64

http://oshiete1.goo.ne.jp/qa2331121.html