PHP 5.4からは 5.3までは出力されなかった【E_STRICTエラー】がデフォルトで出力されるようになっています。 なのでPHPのバージョンを 5.3以下から5.4以上に上げるとE_STRICTエラーが表示されることがよくあります。
自分で書いたソースの場合はエラーの内容を調べて修正するのが一番よいでしょう。
http://goo.gl/moKrOg
そもそもPHPのバージョンが5.3以下の場合は出力されてなかったエラーなので、そもそもエラーを表示させないという手法。 古いPEARパッケージにはこのエラーが含まれていることが多いので以下のようにエラーが出る箇所を【エラー設定】【エラー戻し】で囲むといいでしょう。
// 【エラー設定】E_STRICT , E_DEPRECATED を非表示
$old_error = error_reporting( E_ALL & ~E_STRICT & ~E_DEPRECATED);
// PEARパッケージの処理(例)
require_once 'XML/Unserializer.php'; // 例:PEARの XML::Unserializer は確実にE_STRICTエラーが出ます。
// 何かしらの処理
// 【エラー戻し】
error_reporting($old_error);