cssファイルを編集するときに Google Chromeのデベロッパーツールで値を変更した後、 エディターにその値を持って行きエディターを使って保存したりしてないでしょうか？
そんな面倒なことをしなくても Google Chrome 自体に .css を保存する機能があります。（最新のChromeでは使えなくなりました。代替方法は一番下）
以下の方法でGoogle Chromeを使ってローカルにあるcssファイルを直接編集して保存してみましょう。
デベロッパーツールのウィンドウが画面下表示されます
現在ブラウザで開いている同盟のcssファイル一覧が表示されるのでその中からリンクさせたいファイルを選択する
これで準備はokです。 後は自由に編集しその後に「Command+s」（Macの場合）を押すと保存されリロードしてもその状態がリセットされず残っています。
ローカルのファイルでは動作しませんので node.js や php などでローカルサーバを立てるといいでしょう。
https://chrome.google.com/webstore/detail/finch-developer-tools/phgdjnidddpccdkbedmfifceiljljgdo